在他们的高级一年,所有的九州体育平台学生完成的重大项目资格赛(MQP),专业级的研究或设计项目,使学生解决,而解决的,现实世界的问题在他们的研究领域。在这个过程中,学生综合这些以前的学习,磨练他们的批判性思维和沟通技巧,并学会独立工作。

指导老师,生物信息学和计算生物学学生的指导下,运用bcb中的理论,工具和技术,以便在地区差异,如功能基因组学,疾病预测,再生医学,生物学数据库挖掘和生物多样性。

看到最近的主要合格项目的一些例子:

组织保存通过低温方法

作者:艾丽西亚豪威尔 - 芒森,克里斯汀斯dettloff,约翰schwamb和allesandra托雷斯yabar

顾问:玛莎·罗尔,伊丽莎白·莱德和德斯坦海尔曼

重点:识别和组织样品的冷冻保存后的完整性解决问题。活组织的冷冻保存有效的将是区域从医药到太空探索一个显著的成就。用于保存活细胞和组织的电流的方法是有问题的,由于有毒的冷冻保存剂和水的结晶。这项研究使用的三种药物与大鼠平滑肌组织环的玻璃化。最终结果对常用的10%DMSO进行比较。

 

高通量的C筛选。线虫

作者:akshaye沙阿

顾问:伊丽莎白·莱德

遗传相互作用的研究已经确定机制控制组织特异性基因表达,但具有有限的可扩展性。高通量的图像分析平台的设计与基因构建体结合使用。该构建体的标记的肠细胞中秀丽隐杆线虫,使用的mCherry,和指示使用GFP表达感兴趣的启动子。计算系统创建使用的mCherry信号并量化GFP荧光,输出所述肠内强度量变的掩模。

 

对于急性感染HIV的个体归属关系分析:自然疾病控制研究

作者:凯莉·迪金森

顾问:伊丽莎白·莱德

人类免疫缺陷病毒(HIV)感染〜5000日报新人。只感染者人口少是自然的病毒控制器。该项目的目标是确定相关的艾滋病毒控制与进展者地位体液因素。多元和单变量分析数据相比,HIV特异性的IgG亚类,并在急性感染测定控制器和进展者的抗体依赖性效应子功能。多元方法是有效地从进展者区分控制器,提示没有单一抗体的特征是预测的疾病控制。

 

考研authormap:研究合作在生命科学领域的研究

 作者:阿曼达moulaison和haylea northcott

顾问:梅德korkin和伊丽莎白·莱德 

该项目采用了考研API来创建一个工具,建立表示跨生命科学领域的研究合作网络。每个网络中,节点代表上发布的最后一个作者,而边缘代表出版物共享一个或几个作家。我们的工具显示,大部分的网络展示无标度网络的特征,但不能在统计上证明是无尺度。我们进行了三个网络的案例研究来形容瓶颈作者和他们的合作者之间的关系。

 

调查分枝杆菌亚簇DNA引发酶的异常基因结构

作者:丹尼尔·普林,詹妮弗payano和奥康约恩

顾问:乔安whitefleet - 史密斯和伊丽莎白·莱德

在a4和mycobacteriophages的其他子群集,DNA引物酶是从两个基因与显著重叠了在不同的开放阅读框读制成的双结构域蛋白。这些基因通过一个未知的机制创建一个功能蛋白。使用多序列比对和蛋白质模型不支持内含肽剪接,核糖体移,或形成功能\核基因引物酶的机制RNA聚合酶滑脱我们的调查。初步RT-PCR检测结果表明,这两个结构域在一个成绩单转录。

 

壳多糖受体lyk5是必不可少的在小立碗藓钙介导的信号

作者:凯瑟琳·谢尔曼

顾问:路易斯vidali和伊丽莎白·莱德

植物识别多种不同病原体相关的分子,如几丁质,在真菌的壁发现,为了有效地进行反应。几丁质导致在许多植物中,包括小立碗藓细胞内钙的振荡。该项目的目标是沉默lyk5基因认为检测P中的甲壳素。藓并制定方案,分析了钙反应。当三页。藓lyk5基因沉默了有哪些支持虚拟功能没有任何振荡钙的免疫反应。

 

生物信息学工具的创造和利用,研究提出HIV immunopeptidome模式

作者简介:安 - 伊丽莎白乐

顾问:梅德korkin

今天,估计有38000新感染艾滋病毒仍然会发生在美国(CDC,2020年)。期间由T细胞免疫识别的早期迹象,病毒衍生肽由细胞表面上的MHC分子提呈。 HIV感染,免疫反应和免疫保护都没有得到很好的界定。在这个项目中,我们抗原加工和呈递在分析HIV特异性模式和发展计算工具在分析的加工助剂。从这一研究领域,在蛋白质降解分析和immunopeptidome定义进一步发展可能有助于在确定有效的免疫清除和未来的疫苗设计目标。

 

追踪DNA损伤修复中的癌细胞

作者:Michael corace和亚历山德拉nicolella

顾问:梅德korkin和睦曼宁

该项目旨在了解DNA损伤修复的动力在利用已有的软件和新的分析方法癌细胞。目前的分析工具,允许生物学家独立跟踪细胞运动和计数危害点,但不能同时使用。我们的方法确定了损坏频率比在游动细胞群的时间略有增加。我们建议利用细胞形态学,而不是坐标跟踪这一领域的进一步发展。

 

在荧光成像预测DNA损伤

作者:丹尼尔·麦克唐纳和苏里亚vadivazhagu

顾问:梅德korkin和睦曼宁

有许多方法来分析细胞核,但很少能检测DNA损伤的存在,而无需标记蛋白质。我们已经开发出在DNA损伤的存在的过程中检测和分类细胞的细胞核。这种方法使用DNA相关的组蛋白的形态,而没有特异性标记或定位到DNA损伤位点的蛋白质..我们将讨论如何以及为什么我们解决这个问题,随后程序管道的细节,那么我们的研究结果,以及如何将它与其他的方法,总结和对未来的补充。

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互动排位赛项目

九州体育平台本科生也把自己解决问题的能力,以利用通过大三互动排位赛项目(IQP)。学生团队合作,在科学,技术,社会的交集来解决问题,从设计自行车道在九州体育平台的家乡在摩洛哥推出一个指导方案,孤儿在伦敦博物馆创建交互式指南。